Nuclear speckle protein SON safeguards efficient splicing of GC-rich genes
该研究揭示核斑点蛋白 SON 通过招募 SR 蛋白稳定 U2 snRNP 与 U2AF 在 GC 丰富基因弱剪接位点的结合，从而保障此类基因的高效剪接，并指出 SON 内在无序区的进化扩展对维持这一机制至关重要。
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molecular biology
370 篇论文
ATM safeguards DNA replication at endogenous base lesions
该研究揭示了 ATM 激酶通过抑制 PRIMPOL 介导的异常重引发并调控复制叉停滞，从而防止自发氧化碱基损伤导致复制后修复缺陷，阐明了 ATM 缺失细胞对 PARP 抑制剂产生合成致死效应的分子机制。
FreeTrace enables fractional Brownian motion-based single-molecule tracking and robust anomalous diffusion analysis
FreeTrace 是一种基于分数布朗运动模型的单分子追踪框架，它通过深度神经网络和解析估计器克服传统方法的局限，实现了对短轨迹的鲁棒异常扩散分析，从而在拥挤的细胞环境中更准确地揭示生物分子的动态行为。
Pathogenic Leptospira in dogs and rodents in Tha Wang Pha, Thailand - Prevalence, diversity and linked environments
该研究在泰国南府 Tha Wang Pha 地区首次证实了鼠类携带 L. weilii，并发现流浪狗可能作为桥梁宿主，将多种病原性钩端螺旋体从农田和森林中的啮齿动物传播至人类，强调了在该地区实施“同一健康”综合监测的重要性。
Evaluating codon optimization strategies for mammalian glycoprotein production with an open-source expression vector
该研究利用开源表达载体 pTipi 系统评估了多种密码子优化策略，发现对于哺乳动物同源糖蛋白表达而言，使用天然密码子序列已足以实现稳健生产，而仅在某些特定情况下，采用偏好高频密码子的偏斜策略才能进一步提升产量。
PARG inhibition sequesters nuclear PAR-binding proteins, including XRCC1 and its partners, into nuclear condensates to elicit cytotoxicity
该研究揭示 PARG 抑制剂通过诱导 PAR 依赖性核凝聚体形成，将 XRCC1 等 PAR 结合蛋白隔离并耗尽其核内可用库，从而在非同源重组缺陷背景下产生合成致死效应，并确定了 PAR 结合因子的缺失可作为 PARG 靶向疗法的预测性生物标志物。
Study of the molecular nature of resistance to bifenazate in a Tetranychus urticae Koch Laboratory Strain
该研究首次在中国俄罗斯实验室种群中鉴定出 G126S 突变，并通过结构建模与测序证实该突变在单独存在时足以导致二苯哒嗪的高水平抗性，揭示了抗性演化的种群特异性。
HIV superinfection reveals sequential reservoir reactivation and immune-driven rebound dynamics
该研究通过一例未被临床监测发现的 HIV 超感染案例，揭示了超感染病毒株因预先适应宿主 HLA 而破坏免疫控制、治疗中断后病毒反弹源于 ART 前建立的克隆库且呈现多波次序贯激活，以及宿主免疫压力在反弹过程中驱动逃逸变异株优势生长的动态机制。
Friedreich ataxia transcriptomic dysregulation and identification of cell type-specific biomarkers: A systematic review and meta-analysis
本研究通过整合 23 个人类 FRDA 转录组数据集进行系统综述与荟萃分析，揭示了驱动疾病选择性易感性的细胞类型特异性转录调控机制，鉴定出 MYH14、MEG9 和 MEG8 等潜在生物标志物，并建立了可供社区使用的交互式 FRDA 转录组图谱以推动治疗开发。
HCF1 orchestrates O-GlcNAcylation and affinity-dependent transcription through extended molecular determinants and register-shifted binding
该研究通过大规模筛选和深度突变扫描，揭示了 HCF1 结合伙伴的扩展分子决定因素及注册偏移结合模式，阐明了其通过亲和力依赖性机制调控 IRF1 转录活性并促进多数转录结合蛋白 O-GlcNAc 糖基化的新功能。
Insights into tick-pathogen interactions - a single cell RNA sequencing approach of transcriptional changes during ehrlichial infection
本研究利用单细胞 RNA 测序技术解析了蜱虫胚胎细胞系 ISE6 的细胞异质性及其对 Ehrlichia muris eauclairensis 感染的转录响应，揭示了感染早期应激适应与代谢通路的上调及晚期细胞周期和细胞骨架相关基因的下调，从而证实了该细胞系作为研究蜱传病原体互作及分离培养的有效资源。
Damaging the conical morphology of HIV-1 capsid by targeting the FG-binding pocket and disfavoring pentameric subunits needed for core closure
该研究揭示了靶向 HIV-1 衣壳蛋白 FG 结合口袋的抑制剂 ZW-1261 通过将五聚体亚基转化为六聚体构象，导致衣壳缺乏形成闭合锥体所必需的五聚体，从而破坏病毒核心完整性的分子机制。
Systematic identification of tissue-conserved m6A sites reveals a stable epitranscriptomic regulatory layer controlling essential genes
该研究系统鉴定了人类 24 种组织中保守的 m6A 修饰位点，揭示了由 RBM15/B 介导、YTHDF/UPF1 识别的稳定表观转录组调控层，该层通过标记维持细胞稳态的关键基因，其失调可能驱动癌症中的转录异常。
HDAC inhibitor treatment restores transcriptome, chromatin accessibility and memory deficits in a mouse model for Down syndrome
该研究发现，在唐氏综合征小鼠模型中，使用组蛋白去乙酰化酶抑制剂SAHA恢复组蛋白乙酰化水平，不仅纠正了转录组和染色质可及性的异常，还通过使多余的染色体异染色质化来改善记忆缺陷，揭示了组蛋白乙酰化动态与染色体剂量稳态之间意想不到的表观遗传联系。
Structural basis of translation in transcription-translation coupling
该研究通过解析大肠杆菌转录 - 翻译偶联复合物（TTC）在翻译循环各阶段的冷冻电镜结构，揭示了 NusG 和 NusA 的柔性机制如何介导从松散偶联到紧密偶联再到碰撞状态的转换，并阐明了碰撞状态下核糖体头部摆动受阻引发机械力传导从而导致转录终止的结构基础。
No phenotypes in Ttc22 knockout mice
本研究利用 CRISPR-Cas9 构建的 Ttc22 基因敲除小鼠模型，证实尽管 Ttc22 缺失会部分上调结肠黏膜炎症相关基因，但该基因失活并未对小鼠的生长发育、繁殖力、自发肿瘤发生率或 AOM/DSS 诱导的结肠癌发生产生任何表型影响。
Loss of KMT2D accelerates hypertrophic chondrocyte differentiation and senescence by increasing mitochondrial ROS production
该研究揭示 KMT2D 缺失通过增加线粒体 ROS 产生导致氧化应激，进而加速软骨细胞过早肥大和衰老，阐明了 Kabuki 综合征 1 型骨骼发育异常的分子机制并提出了潜在的 ROS 调控治疗策略。
A circRNA-based uricase replacement therapy for sustained treatment of hyperuricemia
该研究开发了一种基于环状 RNA（circRNA）的尿酸酶替代疗法，通过脂质纳米颗粒递送工程化尿酸酶，在尿酸酶敲除小鼠模型中实现了单次注射后快速且长达 10 周的持续降尿酸效果，有效缓解肾损伤并展现出良好的生物安全性，为高尿酸血症的长期治疗提供了新策略。
Fishing pressure induces changes in DNA methylation in genetically homogeneous marine metapopulations
该研究利用改进的 epiGBS3 技术，在基因流动强烈的海洋鱼类种群中首次提供了证据，表明捕捞压力可在排除年龄结构影响后独立诱导 DNA 甲基化改变，从而揭示表观遗传机制可能是鱼类在强人为选择下快速适应的重要驱动力。
Einstein from Noise: Statistical Analysis
本文对“噪声中的爱因斯坦”现象进行了全面的统计分析，证明了即使输入仅为纯噪声，通过模板对齐和平均的估计过程仍会导致其傅里叶相位和幅度收敛至模板信号的特征，从而揭示了模型偏差导致虚假一致估计的统计机制。